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谭高翼
生物学专业:博士生导师/硕士生导师
生物工程专业:博士生导师/硕士生导师
生物与医药专业(生物工程领域):博士生导师/硕士生导师
简介
谭高翼,理学博士,副教授,博士生导师。2014年3月毕业于上海交通大学生命科学技术学院,获微生物学博士学位,随后在武汉大学药学院从事博士后研究,2016年10月加入suncitygroup太阳新城,为生物反应器工程国家重点实验室固定成员。主要从事合成生物学与代谢工程相关的研究,聚焦CRISPR/Cas技术,微生物发酵与次级代谢等。现已发表学术论文35篇,作为第一作者或通讯作者的代表性成果发表在Nat Commun,Nucleic Acids Res,Sci Bull,Metab Eng,Curr Opin Biotech,ACS Synth Biol,Biotech Bioeng,STAR Protoc等著名期刊上,其中入选F1000推荐论文1篇、ESI高被引论文1篇。申请国家发明专利18项(含PCT申请3项)。近五年在国际化学生物学年会(ICBS2017)、亚洲青年生物工程师研讨会(YABEC2019)等知名学术会议作会议报告10多次(其中邀请报告8次)。带队suncitygroup太阳新城首届(2017)和第二届(2018)本科生iGEM竞赛,并连续获金奖2次。先后主持中国博士后基金、国家自然科学基金青年基金、国家重点实验室开放课题、国家自然科学基金面上项目等,同时担任国家重点研发计划课题负责人。
研究方向
通过CRISPR/Cas等技术体系创建,旨在解决微生物功能性代谢物从挖掘发现到检测、直至最终实现高效微生物合成等技术链中的瓶颈问题,实现微生物药物和高附加值产品创制。
具体方向包括:
(1) 生物技术工具和元件体系开发:基于CRSIPR/Cas建立高效基因克隆/编辑和高通量生物传感/检测系统,以及放线菌改造工具系统的开发。现已建成“CAT-SMELOR”和“CAT-FISHING”两大体系;
(2) 微生物药物和高附加值产品创制: 聚焦光合类球红细菌和放线菌,利用自主开发的工具、元件和底盘系统,实现萜类、卟啉类及聚酮类等功能性代谢产物发现和高效合成。
工作经历
2016.10 至今,太阳集团城网址娱网(生物反应器工程国家重点实验室),历任副研究员、博士生导师
2014. 4 - 2016. 9,武汉大学药学院,博士后/助理研究员
2007. 8 - 2009. 8, 中国农业科学院, 北京畜牧兽医研究所(动物营养学国家重点实验室), 研究助理
主持的科研项目或基金
1. 中国博士后基金,2014 - 2016,负责人
2. 湖北省自然科学基金面上项目,2015 - 2017,负责人
3. 国家自然科学基金青年基金,2016 - 2018,负责人
4. 国家自然科学基金面上项目,2019 - 2022,负责人
5. 国家重点研发计划“合成生物学”专项,2021 - 2025,课题负责人
6. suncitygroup太阳新城,青年交叉创新提升计划,2020 - 2022,负责人
7. 上海交通大学,微生物代谢国家重点实验室开放课题,2022-2024,负责人
教学
1. 本科生课程:天然产物药物与合成生物学,32学时,秋季开课
2. 研究生课程:合成生物学,32学时,秋季开课
3. 博士生课程:Synthetic Biology and Nature Product Discovery,32学时,秋季开课
4. iGEM竞赛项目、大创及本科生毕业设计
部分代表性论文(作为第一或通讯作者)
1. Liang et al., Activating cryptic biosynthetic gene cluster through a CRISPR-Cas12a mediated direct cloning approach.Nucleic Acids Research.2022. 50: 3581-3592. 《Nucleic Acids Research在线发表我校放线菌大型基因簇捕捉和沉默基因簇激活新进展》(2022/3/28)
2. Zhao et al., A versatile biosensing platform coupling CRISPR–Cas12a and aptamers for detection of diverse analytes. Science Bulletin. 2021. 66: 69-77. 《Science Bulletin在线发表我校基于CRISPR技术与核酸适配体的传感检测技术研究新进展》(2020/9/9)
3. Liang et al., A CRISPR-Cas12a-derived biosensing platform for the highly sensitive detection of diverse small molecules. Nature Communications. 2019. 10: 3672.(ESI Highly Cited Paper) 《Nature Communications在线发表我校检测小分子研究的最新进展》(2019/9/3)
4. Shi et al., Screening and engineering of high-activity promoter elements through transcriptomics and red fluorescent protein visualization in Rhodobacter sphaeroides. Synthetic and Systems Biotechnology. 2021. 6: 335-342.
5. Zhao et al., Integrating PCR-free amplification and synergistic sensing for ultrasensitive and rapid CRISPR/Cas12a-based SARS-CoV-2 antigen detection. Synthetic and Systems Biotechnology. 2021. 6: 283-291.
6. Zhang et al., Phosphate limitation increases coenzyme Q10 production in industrial Rhodobacter sphaeroides HY01. Synthetic and Systems Biotechnology. 2019. 4: 212-219.
7. Gao et al., Learn from microbial intelligence for avermectins overproduction. Current Opinion in Biotechnology. 2017. 48, 251-257.
8. Tan et al., Rational synthetic pathway refactoring of natural products biosynthesis in actinobacteria. Metabolic Engineering. 2017. 39: 228-236.
9. Tan et al., Heterologous biosynthesis of spinosad: an omics-guided large polyketide synthase gene cluster reconstitution in Streptomyces. ACS Synthetic Biology. 2017. 6: 995-1005.
10. Tan et al., In vitro reconstitution guide for targeted synthetic metabolism of chemicals, nutraceuticals and drug precursors. Synthetic and Systems Biotechnology. 2016. 1: 25-33.
11. Tan et al., Recent advances in the elucidation of enzymatic function in natural product biosynthesis.F1000Research. 2015. DOI: 10.12688/f1000research.7187.1
12. Tan et al., Engineering validamycin production by tandem deletion of γ-butyrolactone receptor genes in Streptomyces hygroscopicus 5008. Metabolic Engineering, 2015. 28:74-81. (F1000Prime recommended article)
13. Tan et al., Exogenous 1,4‐butyrolactone stimulates A‐factor‐like cascade and validamycin biosynthesis in Streptomyces hygroscopicus 5008. Biotechnology and Bioengineering. 2013. 110: 2984-2993
14. Yang et al., Effects of acute heat stress and subsequent stress removal on function of hepatic mitochondrial respiration, ROS production and lipid peroxidation in broiler chickens. Comparative Biochemistry and Physiology Part C: Toxicology & Pharmacology. 2010. 151: 204-208.
15. Tan et al., Effects of different acute high ambient temperatures on function of hepatic mitochondrial respiration, antioxidative enzymes, and oxidative injury in broiler chickens. Poultry Science. 2010. 89: 115-122
16. Tan et al., Effects of pretreatment by the flavanol ampelopsin on porcine kidney epithelial cell injury induced by hydrogen peroxide. Agricultural Sciences in China. 2019. 9: 598-604.
17. Tan et al., Study of oxidative damage in growing–finishing pigs with continuous excess dietary chromium picolinate intake. Biological Trace Element Research. 2018. 126: 129-140.
18. Tan et al., Effects of chromium picolinate on oxidative damage in primary piglet hepatocytes. Biological Trace Element Research. 2018. 126: 69-79.
专利
1. 提高井冈霉素发酵水平的方法;公开(公告)号:CN103740789B
2. 一种用于光合生物反应器的发光搅拌桨;公开(公告)号:CN207646198U
3. 基于CIRSPR/Cas系统的生物传感器、试剂盒及其在小分子检测中的用途;专利号:201910285607.1; PCT/CN2020/084111
4. 一种生产卟啉类化合物的重组菌及生产卟啉类化合物的方法;申请号:201910999107.4
5. 一种基于CRISPR/Cas12a的体外大片段DNA克隆方法及其应用;专利号:202010575747.5; PCT/CN2020/120332
6. 一种启动子文库及其制备方法和应用;专利号:202011642684.7
7. 基于适配体和CRISPR/Cas12a系统的生物传感器、组合物、试剂盒及其用途;专利号:202110438566.2
8. 微生物发酵中卟啉类化合物的提取方法以及前处理和检测方法;专利号:202211232561.5
9. 一种阿维链霉菌合成培养基及其发酵液的制备方法;公开(公告)号:CN107338210A
10. 一种类球红细菌高产菌株的遗传转化方法;公开(公告)号:CN108795968A
11. 提高链霉菌聚酮化合物产量的方法;专利号:201910411123.7; PCT/CN2020/090452
12. 来源于链霉菌的碳磷化合物及其制备方法与应用;专利号:201910440511.8
13. 核酸检测芯片装置、核酸检测芯片及其制备方法;专利号:202010917447.0
学术报告
1. 第四届合成微生物与生物制造学术研讨会,广州,2022年8月19-22日. 邀请报告
2. 2021年中国生物工程学会第五届青年科技论坛,无锡,2021年7月2日-4日. 邀请报告
3. 2021年第三届国际合成生物学高峰论坛,南京,2021年6月21-22日. 邀请报告
4. 2020年上海市微生物学会青年论坛暨上海合成生物学联盟年会,上海,2020年12月19日. 邀请报告
5. 2020年中国微生物学会年会,成都,2020年10月23日-27日. 口头报告
6. The 25th Young Asian Biological Engineers’ Community (YABEC 2019), 韩国, 首尔, 2019年11月22日-24日. 口头报告
7. 第五届合成生物学青年论坛, 天津,2019年8月17日-18日. 邀请报告
8. 第四届放线菌生物学暨第二届微生物药物学术研讨会,青岛,2019年7月19日-21日. 邀请报告
9. 第二届生物传感、生物芯片与纳米生物技术高端论坛,济南,2019年5月24-25日. 邀请报告
10. The 6th Official Conference of the International Chemical Biology Society (ICBS2017),上海,2017年10月17日-20日. 口头报告
11. 第二届合成微生物学与生物制造学术研讨会. 杭州. 2016年6月17日-19日.口头报告
12. 第二届中国放线菌生物学与产业化研讨会. 广州. 2014年12月8日-9日.口头报告
13. The 12th International Student Seminar. 日本, 京都. 2014年2月15日-21日. 口头报告
14. Asian Congress on Biotechnology 2013 (ACB2013). 印度, 新德里. 2013年12月15日-18日. 口头报
15. The 15th International Biotechnology Symposium and Exhibition (IBS2012). 韩国, 大邱. 2012年9月16日-21日. 口头报告
获奖
2013.10, 上海交通大学, 获“博士研究生国家奖学金”
2013.12, 上海交通大学, 获“上海市优秀毕业生”称号
2014.2, 日本京都大学,受邀参加12th International Student Seminar, 获“优秀墙报奖”
2014.12, 广州,参加《第二届中国放线菌生物学与产业化研讨会》,获得博士论坛“二等奖”
2016.10, 武汉,参加《第十三届国际工业微生物遗传学大会》,获得“最佳墙报奖”
2017.11, 美国波士顿,带队和指导suncitygroup太阳新城本科生首届国际遗传工程机器大赛(iGEM),获团队“金奖”
2018.10. 指导suncitygroup太阳新城本科生首届国际遗传工程机器大赛(iGEM),获团队“金奖”
2019.5. 济南,参加中国生物工程学会《第二届全国生物传感、生物芯片与纳米生物技术高端论坛》,获得青年论坛“一等奖”
2020.10. 成都,参加《2020年中国微生物学会年会》,获得“优秀学术交流奖”
联系方式
太阳集团城网址娱网,生物反应器工程国家重点实验室
地址:上海市徐汇区梅陇路130号,200237
电话:021-64253020
ResearchGate: https://www.researchgate.net/profile/Gao-Yi-Tan
ORCID: https://orcid.org/0000-0003-2272-0159
邮箱:tangy@ecust.edu.cn